Stetoskoopin desinfiointitiheys riippuu käyttöskenaariosta ja ympäristöstä:
Jos stetoskooppia käytetään tavallisilla avohoitoosastoilla vain yleispotilailla eikä ilmeistä kontaminaatiota ole, se on suositeltavaa desinfioida 1-2 kertaa viikossa.
Osastoilla, kuten lasten- ja hengityselinten osastoilla, jotka altistuvat helposti tartuntatautien aiheuttajille, tai erityisalueilla, kuten tartuntatautiosastoilla ja teho-osastoilla, desinfiointi on suoritettava jokaisen käyttökerran jälkeen.
Jos stetoskooppia käyttävät useat eri potilaat lyhyen ajan sisällä, on parasta desinfioida se jokaisen käyttökerran jälkeen, vaikka väli olisikin lyhyt.
